Различные виды ПЦР часто является отправной точкой в серии экспериментов для того, чтобы получить информацию о ДНК.

Обычный способ анализа продуктов ПЦР амплификации ДНК состоит в том, чтобы разделить образцы в геле с агарозным электрофорезом.

Полоса, представляющая амплифицированную ДНК, может стать видимой после окрашивания.

Кроме определения успешности реакции амплификации электрофорез в агарозном геле можно использовать для получения дополнительной информации.

Обработка продукта ПЦР эндонуклеазой рестрикции перед запуском образца в агарозном геле может помочь обнаружить присутствие сайтов рестрикции в шаблоне ДНК. Этот анализ полиморфизма длины фрагмента рестрикции (RFLP) важен для построения карт геномов и изучения генетических заболеваний.

Размер продукта ПЦР можно использовать для определения того, содержит ли ДНК-матрица мутации - вставки или делеции - в амплифицированной области. Этот тип мутаций является основой профилирования ДНК - одного из методов судебной медицины.

Присутствие или отсутствие продукта ПЦР может быть диагностическим признаком. Например, ПЦР используется в качестве процедуры скрининга для идентификации желаемого гена из библиотеки геномной или кДНК или для обнаружения патогенных микроорганизмов в клиническом образце.

Еще два особенно важных метода для изучения продуктов ПЦР включают клонирование и секвенирование продуктов ПЦР.

Некоторые применения полимеразной цепной реакции включают:

  1. идентификация владельца образца ДНК, оставленного на месте преступления;
  2. анализ отцовства;
  3. сравнение небольших количеств древней ДНК с современными организмами;
  4. определяя последовательность нуклеотидов в конкретной области.